Es wird Zeit das die Ausreisser Marty, Alex, Gloria und Melman Madagaskar wieder verlassen und zurueck nach New York reisen. Die Natur dort ist zwar schoen, aber irgendwie vermissen Sie Ihr “Zuhause” den Zoo.
Mit den Pinguinen die ein altes Fleugzeugwrack wieder irgendwie in die Luft bekommen (Riesenkatapult) geht Ihre lustige Reise also nun weiter.
Leider sollte man ein Flugzeug aber vor einem Flug besser mal ein wenig Tanken, und somit landet die lustige Truppe nicht in den USA, sondern in Afrika.
Genau in dem Reservat, wo Alex geboren wurde, und sein Vater, der Loewenkoenig Zuba, Ihn fuer Tot hielt.
Leider sind darueber nicht alle so happy, das Alex wieder da ist: Makuna ein anderer Loewe, der schon seit Jahren darauf wartet auf den Thron des Loewenrudels zu stehen, sieht in Ihm einen Wiedersacher, allerdings auch einen leichten Gegner. Er baut eine Intriege auf, in deren Mittelpunkt Alex steht. Der allerdings weiss noch nichts von seinem Glueck